ゲノミクス研究を加速

インテルとブロード研究所は、ゲノミクス解析のための強力で柔軟なデータセンター・ソリューションに共同で取り組んでいます。

インテル・ブロード・ゲノミクス・データ・エンジニアリング

インテル・ブロード・ゲノミクス・データ・エンジニアリング・センターの研究者およびソフトウェア技術者は、科学者がゲノミクスデータを統合して処理するために役立つ、新しいツールおよびインフラストラクチャーを構築、最適化し、幅広く共有しています。当プロジェクトでは、ゲノム解析のためのハードウェアとソフトウェアのベストプラクティスを最適化し、プライベート、パブリック、ハイブリッド・クラウドに存在する研究データを組み合わせて使用することができます。目的は、世界中の研究者たちがこれまでに利用できなかったデータにアクセスできるようにすることにより、彼らがより迅速に着実な結果を生み出すサポートをすることです。

インテルとブロード研究所は、ゲノミクススタックを提供します

インテルとブロード研究所は、有名なブロード研究所のゲノム解析ツールキットを、これまでにない規模でより容易にオープンソースデプロイメントで実行できるようにするための、新しい統合ハードウェアとソフトウェア・ソリューション を発表しました。 以下のソリューション・パートナーを参照してください。

発見を促進する共通のビジョン

私たちには、世界中の研究者が人間の健康を究極的に向上させていくためにサポートを行うという使命があります。

アンソニー・フィリッパキス 医学博士 ブロード研究所のチーフ・データ・オフィサーが、インテルとブロード研究所のコラボレーションについて説明しています。

ゲノミクス解析への展望

健康とライフサイエンスにおけるソート・リーダーシップの最新動向

ブロード研究所とインテルが提供する Genomics Stack* (BIGstack*)

ブロード研究所とインテルが提供する Genomics Stack* (BIGstack*) が、どのようにしてゲノム研究と全ゲノム・シーケンシングの短時間での実行を可能にしたかご覧ください。

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OpenCL™ と FPGA がゲノム研究を促進 

インテルとブロード研究所が、GATK HaplotypeCaller アルゴリズムを実行する OpenCL™ と FPGA をどのようにゲノム研究に役立てているかご覧ください。 

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インテル® Select ソリューションによる計算ゲノミクスと解析

インテルがブロード研究所と連携し、ハードウェア / ソフトウェア・ソリューションを通じて高度な計算ゲノミクスおよびゲノム解析に取り組む様子をご覧ください。

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GKL 圧縮

GKL 圧縮を最適化すれば、パフォーマンスが最大 2.8 倍向上します。

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GATK* 用インフラストラクチャー

GATK* ゲノミクス解析のためのハードウェアおよびソフトウェアのベストプラクティスを実装。

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FPGA アクセラレーション

FPGA のパワーを利用したハプロタイプ・コーリング / PairHMM 機能のパフォーマンスが大幅に向上しました。

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全ゲノム解析

インテル®クラスタベースのアーキテクチャーにより、全ゲノム変異解析におけるパフォーマンスが加速します。

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カラム型スパース配列としてゲノムデータを格納

GenomicsDB はゲノムバリアントと尤度のためのストレージ・テクノロジーです。

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開発者向けリソース

最適化されたゲノミクス解析のためのオープンソース・フレームワークおよびツール、そして、実装、ベンチマーク、およびカスタマイズのためのコードおよびリファレンス・アーキテクチャーにアクセスしてください。

Genome Analysis Toolkit*

業界をリードする分析ソリューション。主要なサポート・コンポーネントがセットになり、実装がより容易になりました。

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GATK* を入手する

Cromwell

ブロード研究所のワークフロー記述言語 (WDL) をベースにした実行管理エンジン。柔軟性に富んだオープンソース仕様で、ローカルまたはクラウド上での運用に適しています。

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Cromwell を入手する

ゲノミクス・カーネル・ライブラリー

計算カーネルは、64 ビット Linux* および Mac OSX* 環境下でのインテル® アーキテクチャー向けに最適化されています。PairHMM、igzip 圧縮、otc_zlib 圧縮用カーネルが付属。

GKL について詳しく知る、GKL を入手する

ゲノミクス DB

ゲノム変異データ管理向けに高度に最適化されたスパース・データ・アレイ。

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ゲノミクス DB を入手する

Lustre*

並列ファイルシステムにより HPC のビックデータを扱うワークロードに対応。Lustre* ソフトウェア用インテル® ソリューションが付属。

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HTCondor

HPC のワークロード管理、ジョブ・キューイング、スケジューリング、優先順位付け、リソース監視、リソース管理を行います。

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HTCondor を入手する

インテル® Omni-Path アーキテクチャー

低レイテンシー、低消費電力、高スループットを可能にする高性能データセンター通信アーキテクチャー。

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インテル® Omni-Path ソフトウェアを入手

インテル® スケーラブル・システム・フレームワーク (インテル® SSF)

インテル® スケーラブル・システム・フレームワーク (インテル® SSF) は、インテルのコンピューティング、メモリー、ストレージ、ファブリック、ソフトウェア・テクノロジーを統合し、次世代の HPC を実現します。

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ブロード・インテル・ゲノミクス・スタックは、インテルの最新のコンピューティング、ファブリック、メモリー、およびストレージテクノロジーを活用して GATK* を実行するための統合ソリューションです。

インテル®製品

インテル® Xeon® プロセッサー E5 ファミリー

既存のサーバー規模のインフラストラクチャーで高いスループット・スコアを実現します。

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インテル® Xeon Phi™ プロセッサー

堅牢で拡張性に優れたインフラストラクチャーにより、ディープ・ニューラル・ネットワークのトレーニング時間を短縮します。

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