Quartus® II ソフトウェア・バージョン 14.0 の問題により、pll_config.h で定義されている変数CONFIG_HPS_PERPLLGRP_PERNANDSDMMCCLK_CNT構成により、Qsys HPS GUI で NAND コントローラーと SD/MMC コントローラーの両方が無効になっている場合に HPS の起動を停止できます。
この問題を回避するには、可能であれば少なくとも 1 つのコントローラーを有効にするか、手動で#define CONFIG_HPS_PERPLLGRP_PERNANDSDMMCCLK_CNT (4) の値を変更してください。
この問題は、Quartus® II ソフトウェアの今後のリリースで修正される予定です。