インテル® Quartus® II ソフトウェア・バージョン 15.0 以前では、階層型の Qsys メインシステム内の Qsys サブシステムからエクスポートされたNios II割り込みのトリガーに失敗します。
Nios II割り込みレシーバー信号を直接エクスポートする代わりに、IRQ ブリッジ割り込み送信者に接続します。次に、IRQ ブリッジ割り込みレシーバーをトップレベルの Qsys メインシステムにエクスポートします。これにより、Nios IIは IRQ ブリッジ経由で送信された割り込みを受信できるようになります。
あるいは、階層的な配置で Qsys サブシステムではなく、Qsys メインシステムで直接Nios IIシステムを作成します。
この問題は、今後のインテル® Quartus® II ソフトウェアのバージョンで修正される予定です。