Quartus® II ソフトウェア・バージョン 13.1 アップデート 4 以降の問題により、Cyclone® V GX (5CGXFC5C6U19A7) の「PCIe ハード・インターフェイス・ピンを表示」では、下部トランシーバー・バンクにある PCIe® ハード IP と PIN R16 (nPERSTL0) が誤って表示されています。
トランシーバー・バンク下部にあるハード IP の正しいピン位置は、PIN R17 (nPERSTL1) です。
この問題は現在、Quartus® II ソフトウェアの今後のバージョンで修正される予定です。