はい。行 I/O バンクの専用クロック入力で LVPECL を使用すると、Quartus® II ソフトウェア・バージョン 7.2 SP3 以前では、LVPECL クロック入力と同じバンクの出力ピンに 3.0V および 3.3V の I/O 規格を誤って割り当てることができます。
STRATIX® III デバイスの行バンクにある専用クロック入力ピンで LVPECL を使用する場合、VCCPD は 2.5V に接続する必要があります。VCCPD が 2.5V に接続されている場合、I/O バンクは 2.5V 以下の電圧に対してのみ出力動作をサポートできます。
この問題は、Quartus® II ソフトウェアの今後のリリースで修正される予定です。