pin_assignments.tcl を実行してコンパイルを実行すると、以下のような警告が表示されます。
警告 (181009): DQS I/O ピン「I/O パッド・mem_dqs[]」が割り当てられた異なる I/O 規格によって供給される DQ I/O ピン - 同じ DQS I/O ピンによってフィードされるすべての DQ I/O ピンは、同じ I/O 規格を持つことをお勧めします
合法性チェックでは、差動およびシングルエンド I/O 規格が同じであるという理解ができないためです。
この問題は、インテル® Quartus® Prime ソフトウェアのバージョン 13.0 で修正されました。