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デザイン実装で不揮発性ストレージ容量が必要な場合は、ストレージデバイスの指定セクターに格納されたコンフィグレーション・ビットストリームの後に、コンフィグレーション・ビットストリームの前やコンフィグレーション・ビットストリーム内に保存することはできません。FPGAはコンフィグレーション・ビットストリームを読み取った後でユーザーモードに入り、ストレージ・デバイスの残りのデータは無視されます。